Arcybiskup Meisner uważa, że Merkel powinna przeprosić papieża za domaganie się od niego jednoznacznego stanowiska w związku ze zdjęciem ekskomuniki z negującego Holokaust biskupa Wiliamsona. W wywiadzie dla dziennika Bild hierarcha skrytykował szefową rządu za, jak to określił, połajanki pod adresem głowy Kościoła. Zdaniem kardynała Meisnera, Merkel powinna okazać wielkość i przeprosić papieża. Niemiecki rząd twierdzi jednak, że nie jest to konieczne. Jak powiedział w Berlinie jego rzecznik, kanclerz Merkel wypowiadała się na ten temat w licznych wywiadach i nie ma nic do dodania w tej sprawie.
W lutym pani kanclerz powiedziała, że Benedykt XVI powinien jasno dać do zrozumienia, że zdjęcie ekskomuniki z czterech lefebrystów, w tym również biskupa Williamsona, nie oznacza przyzwolenia na negowanie Holokaustu. Tę wypowiedź krytycznie odebrała część niemieckiego duchowieństwa, a także konserwatywne skrzydło CDU, na czele której stoi Merkel.