24 pażdziernika 1960 roku na tzw. platformie 41 kosmodromu doszło do największej katastrofy w historii techniki rakietowej. Na pół godziny przed startem nowej rakiety P-16, niespodziewanie doszło do uruchomienia się mechanizmu startowego. Gorące gazy i paliwo pod ciśnieniem wystrzeliły ze zbiorników i zalały teren wokół. W tym momencie znajdowało się tam kilkudziesięciu pracowników i naukowców. Zginęło wówczas 74 osób, ponad 50 zostało rannych i poparzonych.
Dokładnie trzy lata później w 1963 roku na platformie startowej rakiety P-9 doszło do pożaru, zginęło wówczas 8 osób.
Dlatego 24 paździenrika ogłoszono Dniem Pamięci w Bajkonurze. W tej dzień wstrzymane są starty z kosmodromu, nie odbywają się tam żadne prace.