Zdaniem posłów Sojuszu, ustawa narusza wiele artykułów Konstytucji. Według nich, niejasny jest między innymi tryb powoływania członków komisji majątkowej. Grzegorz Napieralski zapewnił na konferencji prasowej, że nie jest to wojna z Kościołem, a realny rozdział tej instytucji od państwa. Jego zdaniem, duchowni nie zrobili nic, by poprawić relacje z państwem, a niektórzy hierarchowie posługują się językiem agresji. Pod wnioskiem do Trybunału podpisało się około 50 posłów ugrupowań lewicowych oraz poseł PO, Janusz Palikot.
Rządowo-kościelna Komisja rozstrzyga wnioski o zwrot Kościołowi dóbr, które obecnie należą do Skarbu Państwa.