Podczas uroczystości pożegnania papież powiedział, że pielgrzymka do miejsc szczególnie drogich Janowi Pawłowi II bardzo zbliżyła go do Polaków. Benedykt XVI wyraził radość z możliwości odwiedzenia miejsc szczególnie ważnych dla naszej historycznej i duchowej tożsamości.
Papież przypomniał słowa Jana Pawła II, który - opuszczając Ojczyznę po raz ostatni - wyraził nadzieję, że Polacy kierując się zasadami chrześcijaństwa nie tylko znajdą właściwe miejsce w zjednoczonej Europie, ale wzbogacą swą tradycją ten kontynent. "Dziś, gdy wasza obecność w rodzinie państw Europy jest coraz bardziej ugruntowana, pragnę z całego serca powtórzyć te słowa nadziei. Proszę was, abyście pozostawali wiernymi strażnikami chrześcijańskiego depozytu, byście go strzegli i przekazywali następnym pokoleniom" - powiedział Benedykt XVI.
Żegnając papieża Lech Kaczyński podziękował mu za okazywaną Polsce i Polakom życzliwość. Prezydent wyraził także wdzięczność za poruszające i bliskie w treści przemówienia Benedykta XVI.
Na podkrakowskim lotnisku Balice papieża żegnało około 5 tysiecy wiernych.