WSA nie zajmował się jednak kwestią zwrotu akcyzy, która zdaniem sądu jest bezsporna i wynika ze styczniowego wyroku Europejskiego Trybunału Sprawiedliwości. Zajął się natomiast sprawą nadpłaty akcyzowej i orzekł, że decyzję o wysokości nadpłaty jaką obywatele mogą odzyskać, powinny podejmować organy celne.
Sąd wyjaśnił też, że wysokość nadpłaty będzie stanowić różnica między tym to, co podatnik zapłacilby za auto sprowadzane z zagranicy a tym co zapłaciłby za takie samo auto kupione w kraju. Podstawą liczenia nadpłaty nie będzie więc cena wpisana na umowie sprzedaży, ale wartość podobnego pojazdu w Polsce.