Najwyższa Izba Kontroli krytycznie ocenia sposób gromadzenia i gospodarowania państwowymi rezerwami zbóż. NIK negatywnie wypowiada się także na temat nadzoru nad tymi rezerwami.
Przeprowadzona kontrola ujawniła braki ilościowe w stanach rezerw zbóż państwowych oraz obniżenie norm jakościowych znacznej ich części na skutek zaatakowania ziarna przez szkodniki zbożowo-mączne, choroby grzybowe oraz nadmierne zanieczyszczenie.
Stwierdzono również nieprawidłowości polegające na składowaniu zbóż w miejscach innych niż określone w umowach oraz przechowywanie zbóż stanowiących rezerwy państwowe łącznie ze zbożem należącym do osób trzecich.
Jedną z przyczyn tego stanu były wadliwe umowy w sprawie przechowywania rezerw, zawierane przez Agencję Rynku Rolnego z przedsiębiorstwami. Umowy te nie przewidywały sankcji za powyższe uchybienia.
W ocenie Najwyższej Izby Kontroli nieprawidłowości te są wynikiem niedostatecznego nadzoru nad tworzeniem, gospodarowaniem oraz przechowywaniem rezerw państwowych zbóż. W szczególności dotyczy to Agencji Rynku Rolnego, która tworzyła i gospodarowała rezerwami państwowymi do marca 2004-ego roku oraz ministra gospodarki, do zadań którego należało, między innymi, sprawowanie funkcji kontrolnej w zakresie rezerw w stosunku do Agencji Rynku Rolnego.