Nawiązując do niedawnej publicznej dyskusji, w której rozważono likwidację pionu śledczego IPN, Leon Kieres powiedział, że przeniesienie śledztw kierowanych przez IPN do prokuratur powszechnych byłoby bardzo niefortunne. "Koszmar przeszłości, które emanuje z każdego śledztwa prowadzonego przez IPN obciążałby prokuratorów prokuratur powszechnych" - mówił Leon Kieres. Przypomniał, że pion śledczy zakończył 1200 postępowań, w wyniku których sformułowano 30 aktów poskarżenia.
Jeden ze zwolenników likwidacji pionu śledczego, wicemarszałek senatu Ryszard Jarzembowski z SLD ironizował, że skoro z takim uporem prezes trwa przy konieczności istnienia pionu śledczego IPN, a więc osobnej prokuratury, to " może jeszcze sądownictwo zrobić osobne".
Pomysł likwidacji pionu śledczego IPN krytukuje opozycja. Prezydent Aleksander Kwaśniewski uznał tę propozycję za nie do końca przemyślaną.Także premier Leszek Miller powiedział, że projekt likwidacji pionu śledczego Instytutu nie znajdzie się w kręgu zainteresowania klubu SLD ani rządu.
