Biskup Józef Guzdek urodził się 18 marca 1956 roku w Wadowicach. Pochodzi z parafii świętego Jana Chrzciciela w Choczni. Po zdaniu matury w Liceum Ogólnokształcącym imienia M. Wadowity w roku 1975 rozpoczął studia w Metropolitalnym Wyższym Seminarium Duchownym w Krakowie. Święcenia kapłańskie otrzymał 17 maja 1981 roku w katedrze na Wawelu przez posługę kardynała Franciszka Macharskiego.
Jako wikariusz pracował w parafiach: Świętych Apostołów Piotra i Pawła w Trzebini, świętego Klemensa w Wieliczce i w kolegiacie akademickiej świętej Anny w Krakowie. W latach 1994-1998 pełnił funkcję prefekta w Wyższym Seminarium Duchownym Archidiecezji Krakowskiej. W kwietniu 1998 roku ksiądz Józef Guzdek uzyskał tytuł doktora teologii na Wydziale Teologicznym Papieskiej Akademii Teologicznej w Krakowie, na podstawie rozprawy napisanej pod kierunkiem księdza profesora Edwarda Stańka pod tytułem "Koncepcja narodu i jego wolności w kaznodziejskim przekazie księdza Hieronima Kajsiewicza".
W latach 1998-2004 pełnił funkcję kierownika Studium Formacji Stałej dla kapłanów archidiecezji krakowskiej. Od czerwca 1999 roku do 11 września 2001 roku był dyrektorem Wydawnictwa świętej Stanisława BM Archidiecezji Krakowskiej. 12 września 2001 roku został mianowany przez kardynałą Franciszka Macharskiego rektorem Wyższego Seminarium Duchownego Archidiecezji Krakowskiej.
14 sierpnia 2004 roku papież Jan Paweł II mianował księdza Józefa Guzdka biskupem pomocniczym metropolity krakowskiego i przydzielił mu stolicę tytularną Treba.
Jako dewizę swojego posługiwania biskup Józef Guzdek przyjął słowa "In Te Domine speravi" (Tobie, Panie, zaufałem). Święcenia biskupie kapłan przyjął 15 września 2004 roku w Sanktuarium Bożego Miłosierdzia w Krakowie-Łagiewnikach.
Głównym konsekratorem był kardynał Franciszek Macharski, a współkonsekratorami arcybiskup Józef Kowalczyk - obecny prymas Poslki - i ówczesny arcybiskup Stanisław Dziwisz - w tej chwili kardynał, metropolita krakowski.
W latach 2004 2010 biskup Józef Guzdek był wikariuszem generalnym archidiecezji krakowskiej. W roku 2006 przewodniczył krakowskiemu zespołowi przygotowującemu pielgrzymkę papieża Benedykta XVI do Polski. W strukturze Konferencji Episkopatu Polski pełni obowiązki wiceprzewodniczącego Rady do spraw Apostolstwa Świeckich, delegata do spraw. Ruchu "Wiara i Światło" oraz Stowarzyszenia "Arka".
Papież Benedykt XVI mianował biskupa Józefa Guzdka biskupem polowym Wojska Polskiego 4 grudnia.
