Dotąd jednak likwidatorzy WSI skierowali do prokuratury tylko sprawę dokumentów wojskowych służb PRL. Podejrzewają bowiem, że WSI nie przekazały do IPN wszystkich posiadanych materiałów. Równocześnie IPN bada działalność wydziału "Y", który był częścią wojskowych służb PRL.
Szef sejmowej komisji służb specjalnych Janusz Zemke z rezerwą podchodzi do zapowiedzi Antoniego Macierewicza. "Na razie jest to jedna sprawa. Tezy, że są to dziesiątki czy setki spraw są przesadzone. Zobaczymy, co będzie, kiedy raport się ukaże" - mówił Zemke. Raport z likwidacji WSI ma zostać opublikowany 1 lutego.
Z danych sejmowej komisji wynika też, że w ciągu ostatnich pięciu lat prokuratura wojskowa prowadziła 132 sprawy dotyczące żołnierzy WSI. Były to głównie wypadki i drobne kradzieże i nie miały związku z likwidacją WSI.