Prałat Henryk Jankowski oświadczył, że żałuje niektórych pomysłów realizowanych w ramach Instytutu sygnowanych jego nazwiskiem.
Duchowny podkreślił, że niektóre sprawy związane z placowką odbywały się bez jego kontroli. Podkreślił przy tym, że zamyka dzialność swojego Instytutu dla uzdrowienia całej sytuacji.
Nieoficjalnie mówi się, że do rozwiązania Instytutu miał przekonać prałata metropolita gdański Sławoj Leszek Głódź. Sekretarz prasowy metropolity ksiądz Tomasz Biedrzycki potwierdza, że rozmowa w sprawie instytutu była, ale decyzję o jego zamknięciu prałat podjął sam i jest to - zdaniem przełożonych księdza - dobra i mądra decyzja.
Ksiądz Biedrzycki uważa, że jest to dobra wiadmość, także ze względu na stan zdrowia księdza prałata.
Instytut miał pierwotnie zbierać dokumenty na temat roli Kościoła katolickiego w historii PRL. Do tej pory wydał jedynie kilka książek, planowano otwarcie klubo-kawiarni internetowych.
Instytut prowadził też działalność handlową sprzedawał wodę i wino z wizerunkiem prałata Jankowskiego. W planach były kosmetyki, koszulki z nadrukiem i sieć telefonii komórkowej.