Ksiądz Henryk Jankowski został pochowany w krypcie kościoła świętej Brygidy w Gdańsku. We Mszy św. odprawionej przez metropolitę gdańskiego arcybiskupa Sławoja Leszka Głódzia wzięło udział kilka tysięcy osób.
Decyzję o pochowaniu księdza prałata Jankowskiego właśnie w tym kościele podjął metropolita. Prałat przez ponad 30 lat był proboszczem parafii św.Brygidy. Dzięki jego staraniom odbudowano świątynię. W stanie wojennym kościół i plebania były miejscem działalności i spotkań opozycji.
Grób kapelana "Solidarności" będzie skromny - zapowiada proboszcz parafii św. Brygidy ksiądz Ludwik Kowalski. Na posadzce znajdzie się zwykła prosta marmurowa płyta z napisem.
Grób księdza Henryka Jankowskiego znajduje się w tylnej części nawy północnej kościoła świętej Brygidy, w pobliżu rzeźby przedstawiającej postać księdza Jerzego Popiełuszki.
