Fundacja od 1999 roku wspiera przedsięwzięcia ludzi młodych, związane z edukacją i kulturą. Dzięki fundowanym stypendiom większe szansce na zdobycie wykształcenia ma młodzież ze wsi i mniejszych miejscowości. Przewodniczący zarządu Fundacji, Marek Zdrojewski przypomina, że organizacja opiekuje się obecnie 1600 stypendystami w różnym wieku - od gimnazjum, po uczelnie wyższe.
Fundatorem organizacji jest Konferencja Episkopatu Polski, ale także prywatni darczyńcy. Dzieło Nowego Tysiąclecia co roku wręcza także nagrody TOTUS. To wyróżnienia za szczególny wkład w promocję słów nauczania Jana Pawła Drugiego.
Fundacja od 6 lat organizuje także Dzień Papieski. W tym roku, główne uroczystości odbędą się w niedzielę. W całym kraju odprawione zostaną msze święte, a wieczorem na Placu Zamkowym w Warszawie odbędzie się wielki koncert - "Tajemnica Światła - Tajemnica Miłosierdzia, Pieśń o Janie Pawle Drugim". Transmitować go będzie Program Pierwszy Polskiego Radia.
