Podejrzany funkcjonariusz prowadził działania, mające na celu eliminację księdza Popiełuszki jako duszpasterza środowisk związanych z opozycją demokratyczną. Według prokuratorów, działania są zbrodnią komunistyczną. Miała ona formę represji, oraz naruszania podstawowych praw człowieka - prawa do uczciwego procesu, do obrony w postępowaniu karnym oraz prawa do wolności słowa i wyznania.
Sprawa jest wielowątkowa. Wiąże się z prowadzonym w Oddziałowej Komisji Ścigania Zbrodni przeciwko Narodowi Polskiemu w Warszawie śledztwem w sprawie działającego w strukturach komunistycznego MSW związku, który miał na celu dokonywanie przestępstw, w tym zabójstw działaczy opozycji politycznej i duchowieństwa.