Minister dodaje, że objęcie systemem Natura 2000 nie znaczy, iż na danym terenie nie mogą być prowadzone żadne inwestycje. Prace na obszarze Natury mogą być realizowane jeżeli nie przeszkadzają chronionemu gatunkowi.
Obszarami Natura 2000 zarządzać będą regionalni dyrektorzy chrony środowiska oraz dyrektorzy parków narodowych. Generalny dyrektor ochrony środowiska Michał Kiełsznia podkreśla, że Natura 2000 otwiera szansę na uzyskanie dodatkowych funduszy unijnych.
Natura 2000 jest systemem ochrony zagrożonych składników różnorodności biologicznej Europy. System jest wdrażany na terytorium UE od roku 1992.