Jacek Protas przewodniczył tej organizacji od początku 2009. roku. W ubiegłym roku prezydencję miał przejąć przedstawiciel samorządu litewskiego. Jednak ze względu na reformę samorządową Rada Euroregionu przedłużyła kadencję Jacka Protasa o kolejny rok.
Jak twierdzi marszałek Warmii i Mazur, przez ten czas udało się zwiększyć rolę Euroregionu na arenie międzynarodowej. W ostatnich latach Unia Europejska przygotowała strategię Europa 2020, strategię dla państw regionu Morza Bałtyckiego, a także plan wykorzystania środku w latach 2014-2020. Euroregion Bałtyk aktywnie uczestniczył w tych procesach.
Jak dodaje marszałek Protas, prezydentura państwa spoza Unii Europejskiej niesie ze sobą wiele korzyści. Może wzmocnić strategiczne partnerstwo Unii Europejskiej z Rosją i stosunki polsko-rosyjskie.
Euroregion Bałtyk to jedna z największych tego typu organizacji w Europie, zarówno pod względem liczby uczestniczących stron, obszaru oraz ludzi zamieszkujących te regiony.
Do Euroregionu należą województwa pomorskie i warmińsko-mazurskie, a także Obwód Kaliningradzki w Rosji oraz niektóre regiony Litwy, Łotwy, Szwecji i Danii. Ich przedstawiciele wspólnie decydują o rozwoju południowego obszaru Morza Bałtyckiego.
