Sumienie Kadafiego obciążała przede wszystkim wieloletnia pomoc dla Irlandzkiej Armii Republikańskiej. IRA korzystała ze szkoleń w Libii, z libijskich pieniędzy, broni, amunicji, a przede wszystkim kilku ton Semtexu, który umożliwił jej konstruowanie potężnych bomb. Inna zbrodnia popełniona w imieniu Kadafiego to zastrzelenie w 2004 roku z okna ambasady w Londynie młodej brytyjskiej policjantki. Yvonne Fletcher strzegła porządku podczas demonstracji przeciwników Kadafiego przed ambasadą. Na wyjaśnienie tego zabójstwa do dziś czekają jej matka i policjant, który poprzysiągł umierającej mu na rękach koleżance, że sprawca stanie przed sądem. Najgorsza ze zbrodni, którą obciąża się Kadafiego, to podłożenie bomby na pokładzie samolotu linii PanAm w 1988 roku. Zginęło wówczas 259 osób na pokładzie i 11 mieszkańców miasteczka Lockerbie w Szkocji. Nie wszyscy zgadzają się jednak, czy ta zbrodnia była rzeczywiście dziełem reżimu libijskiego czy może Iranu.