Ceny transferowe są tematem bardzo kontrowersyjnym. Z jednej strony bardzo dobrze, że oragany pofatkowe walczą z przerzucaniem dochodów za granicę. Jednak z drugiej strony należy brać pod uwagę coraz trudniejsze warunki panujące na rynku, stale wzrastającą konkurencję w większości branż i konieczność podejmowania działań, mających na celu zdobycie nowego klienta lub utzymanie dotychczasowego (w przypadku sprzadaży). Poza tym bardzo trudno jest ustalić sztywny przedział ceny rynkowej. Organy podatkowe często zapominają uwzględnić ekonomiczne aspekty realizowanych transakcji. Ich błędne decyzje często prowadzą do poważnego zadłużenia polskich przedsiębiorstw powiązanych z zagranicznymi lub - w skrajnych przypadkach - do ich bankructwa.