Nie bardzo rozumiem powód wyrejestrowania.

W kwestii ubezpieczeniowej:
pracodawca mógł wyrejestrować Panią z ubezpieczeń tylko w przypadku rozwiązania umowy o pracę. Jeśli tak było- miała pani obowiązek w ciągu 7 dni poinformować zleceniodawcę o zmianie Pani sytuacji ubezpieczeniowej.
Nie mógł natomiast wyrejestrować mimo trwania umowy.
Jeśli niezdolność do pracy orzeczono już po wyrejestrowaniu z tytułu umowy o pracę- to wysokość zasiłku chorobowego, a potem macierzyńskiego zostanie wyliczona z wynagrodzenia/wynagrodzeń ze zlecenia, wynagrodzenia z etatu pozostaną bez wpływu.