Senatorowie wprowadzili do ustawy blisko 40 poprawek, Sejm przyjął niemal połowę z nich. Wśród nich te, zmierzające do zapewnienia corocznego przekazywania Funduszowi Medycznemu wpłaty z budżetu państwa w wysokości nie niższej niż 4 mld zł rocznie począwszy od 2021 r. Zgodnie z przedłożeniem prezydenckim (i ustawą, która została przyjęta przez Sejm), limit wydatków w latach 2021-2029 miał wynosić maksymalnie 4 mld zł na rok. W roku 2020 ma to być 2 mld zł.
Przyjęto też poprawkę zakładającą zlecanie przez ministra właściwego do spraw zdrowia, w drodze porozumienia, innemu podmiotowi realizacji przewidzianych w ustawie zadań Funduszu Medycznego lub ich części.
Poparcia nie znalazła natomiast propozycja Senatu, by finansowaniem z subfunduszu modernizacji podmiotów leczniczych mogły obejmować wsparcie rozwoju infrastruktury udzielania nie tylko świadczeń opiekuńczo-leczniczych, lecz również pozostałych świadczeń opieki zdrowotnej. Posłowie nie zgodzili się także, by minimalna wysokość środków finansowych przeznaczanych corocznie na finansowanie ochrony zdrowia, nie obejmowała corocznych wpłat z budżetu państwa na rzecz Funduszu Medycznego.
Zgodnie ustawą o świadczeniach opieki zdrowotnej finansowanych ze środków publicznych, na finansowanie ochrony zdrowia na ten cel mają zostać przekazane rocznie środki w wysokości nie niższej niż 6% PKB, z zastrzeżeniem, że w roku 2021 nie może to być mniej niż 5,3% PKB (w 2022 r. - 5,55% PKB i w 2023 r. - i 5,8% PKB).
Ustawa o Funduszu Medycznym zakłada przeznaczenie dodatkowych środków na ochronę zdrowia. Ustawa w wersji przyjętej przez Sejm zakładała, że limit wydatków na fundusz będzie wynosił nie więcej niż 2 mld zł w 2020 r. i 4 mld zł w kolejnych latach do 2029 r. Z funduszu mają być dofinansowywane przebudowa, modernizacja lub doposażenie strategicznych podmiotów ochrony zdrowia, szpitali, programy profilaktyczne, innowacyjne terapie lekowe, a także świadczenia opieki zdrowotnej udzielane świadczeniobiorcom poza granicami kraju.
Fundusz ma być państwowym funduszem celowym, którego dysponentem ma być minister zdrowia. W jego ramach Funduszu zostały wyodrębnione subfundusze, obsługując e konkretne obszary ochrony zdrowia:
- subfundusz infrastruktury strategicznej;
- subfundusz modernizacji podmiotów leczniczych;
- subfundusz rozwoju profilaktyki;
- subfundusz terapeutyczno-innowacyjny
Ustawa wskazuje przychody Funduszu, którymi mają być: wpływy z tytułu opłat od wydania opinii przez wojewodę lub ministra zdrowia dot. celowości budowy podmiotu leczniczego, nowych jednostek lub komórek organizacyjnych lub innej inwestycji tego rodzaju, dotacje z budżetu państwa, z części której dysponentem jest minister zdrowia, odsetki od zgromadzonych środków, dobrowolne wpłaty, darowizny i zapisy oraz wpływy z innych tytułów.
